Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMER3Q8N944 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMER3Q8N944 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms