Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms