Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT27Q7Z3Y8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms