Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms