Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGPD4Q7Z3J3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms