Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDXQ7Z353 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms