Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms