Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms