Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms