Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms