Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYDE1Q6ZW31 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms