Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF493Q6ZR52 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF493Q6ZR52 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms