Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms