Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms