Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6P435 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6P435 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms