Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP5Q6NZY7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms