Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms