Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms