Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q5VSD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q5VSD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q5VSD8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q5VSD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q5VSD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms