Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF3Q5SZQ8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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