Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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