Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC158Q5M9N0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms