Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms