Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A12Q504Y0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms