Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBRG1Q3YBR2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms