Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ANKRD55Q3KP44 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms