Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC57Q2TAC2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms