Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms