Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK5Q16478 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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