Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCBQ16143 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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