Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS72Q15906 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms