Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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EFNB3Q15768 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB3Q15768 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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