Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP10Q15642 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIP10Q15642 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms