Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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