Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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