Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMD6Q15008 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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