Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms