Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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COL19A1Q14993 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL19A1Q14993 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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