Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms