Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A1Q14973 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A1Q14973 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms