Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT1Q14517 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT1Q14517 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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