Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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