Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TOP3AQ13472 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TOP3AQ13472 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TOP3AQ13472 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TOP3AQ13472 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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