Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RESTQ13127 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RESTQ13127 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RESTQ13127 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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