Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BNIP1Q12981 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms