Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms