Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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