Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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NFIAQ12857 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFIAQ12857 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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