Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms