Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms